理财通和余额宝的区别在于：
1、背景公司不同：财通是腾讯旗下的上海腾富金融信息服务有限公司代销的理财产品，而余额宝是支付宝旗下的一款现金增值业务，二者都不能发行产品，都是基金或理财的产品代销机构。
2、理财通里面的余额+和余额宝都是货币基金，但从目前对接的产品数量上看，余额宝对接的货币基金种类更多，而余额+有限。并且余额宝里面的产品可以自由切换，但目前余额+还不能自由切换。
3、灵活性不同：余额宝里面的资金可以用于消费，转账，红包等，但理财通里面的资金不能消费，不能转账，只有零钱通里面的资金才可以。
4、收益率不同：虽然都对接的是货币基金，但由于对接的产品标的不同，所以收益不同，货币基金的7日年化收益是变动的，所以可能这一期余额宝高，下一期就理财通高了。
总的来说，投资者可以根据自己的用户习惯，来选择将资金放在理财通或者余额宝。