新农合异地就医医保报销流程是：
1、异地就医备案：患者到医院办理住院前，向参合地经办机构申请办理异地就医转诊，也可以通过电话、短信和互联网联系参合地经办机构申请办理或补办异地就医转诊。
2、异地定点医疗机构就医，医务人员开具住院证明。
3、患者持身份证、社保卡、入院证明、转诊单或转诊短信通知办理入院手续，确保人证相符。
4、患者住院治疗。
5、患者出院时直接在新农合结算，缴纳自付费用。
6、医院为患者提供结算单、住院明细，留存发票原件，垫付新农合报销费用，定时将票据交到患者所在地新农合经办机构。
如果没有实时完成住院报销，需要就医医院开具一份《跨省就医转诊患者出院未享受即时结报服务说明》，就需要凭患者本人身份证或户口本、社保卡、病历复印件、住院结算单、住院费用清单、转诊备案手续并回到参合地报销。