放入余额宝中的资金会被投资一些货币基金，其收益一般按照万份来计算的，即其计算公式为：收益＝已确认金额／10000×当日万份收益，比如，投资者放入余额宝中100万元，其万分收益为0.5，那么，投资者一天的收益＝1000000／10000×0.5＝50元，其中每日万分收益有所不同，挑选的基金不同，其收益也有所不同。
需要注意的是，投资者在15:00之后买入的，则其买入单需要在下一个交易日才确认份额，下下一个交易日才开始计算收益，15:00之前买的单，在当天晚上确认份额，下一个交易日开始计算收益。
同时，用户存入余额宝中的资金被用来购买货币基金，其份额在节假日之前确认了，则在节假日有收益，反之，在节假日之前没有确认，则在节假日没有收益。